Bár az SLO ritka betegség, a középsúlyos esetek felismerése gyakorlott diagnoszta számára viszonylag könnyű az olyan látványos testi tünetek miatt, mint a többujjúság, szájpad hasadék, alacsonyan álló fülek, stb. Nehezebb a helyzet az enyhébben illetve a nagyon súlyosan érintett betegnél. Enyhe esetekben gyakran csak a 2-3. lábujjak összenövése az egyetlen szembeötlő abnormalitás, amiből ki lehet indulni. A legsúlyosabb esetekben pedig élettel össze nem egyeztethető rendellenesség áll fent, amikor is az életmentés az elsődleges szempont nem pedig a diagnózis felállítása.
Gondos tényfeltárást és gyakorlottságot igényel az SLO megkülönböztetése a következő szindrómáktól és betegségektől:
- Betasitosterolemia;
- Campomelic dwarfism;
- Denys-Drash;
- Desmosterolosis;
- Dubowitz;
- Gardner-Silengo-Wachtel;
- hydrolethalus; Meckel-Gruber;
- mevalonic aciduria;
- Nguyen;
- Noonan;
- Pallister-Hall hamartoblastoma;
- Pierre Robin;
- pseodutrisomy 13;
- Russell-Silver;
- Simpson-Golabi-Behmel;
- Zellweger